Die ausgeschiedenen Probebäume werden im Zuge der Waldzustandserhebung nach objektiven Kriterien ersetzt. Die Schadstufenverteilung der Ersatzbäume wird der ihrer Vorgänger zum jeweils letzten Bonitierungstermin gegenübergestellt. Auf diese Weise kann abgeschätzt werden, welchen Einfluss Ausscheiden und Ersatz der Probebäume auf die Schadstufenverteilung und die Entwicklung der Waldschäden hat.

In 2020 wurden an drei ruhenden Aufnahmepunkten neue Probebäume ausgewählt und erstmals bewertet. Diese sind vergleichsweise jung und haben ein entsprechend niedriges Schadniveau. Ebenfalls wurden in 2020 relativ viele abgestorbene Bäume (Schadstufe 4) im Rahmen der Borkenkäferbekämpfung mit gefällt.
Über die komplette Zeitreihe zeigt sich durchgehend, dass die Ersatzbäume eher selten der Schadstufe 3 und 4 angehören. Auch ist in den letzten Jahren ein höherer Anteil an Laubbäumen unter den Ersatzbäumen als unter ihren Vorgängern.

Normalerweise entsprechen die Ersatzbäume in Baumart und Alter ihren Vorgängerbäumen. In Mischbeständen kommt es aber vor, dass durch die Ersatzbäume eine Verschiebung zu einer anderen Baumart erfolgt. In ungleichaltrigen Waldbeständen kann es sein, dass die Ersatzbäume aus dem nachwachsenden Jungbestand ausgewählt werden, sobald im Altbestand keine geeigneten Ersatzbäume mehr vorhanden sind. Fällt ein Aufnahmepunkt in seiner Gesamtheit aus, so wird geprüft, ob unter dem alten Bestand bereits ein Nachfolgebestand etabliert ist, aus dem die Probebäume komplett neu ausgewählt werden können. Ist dies nicht der Fall ruht die Aufnahme an diesem Punkt, bis ein Nachfolgebestand vorhanden ist. Die "Ersatzbäume" sind dann wesentlich jünger und weisen damit im Allgemeinen ein geringeres Schadniveau als die älteren Vorgängerbäume auf. Diese Verjüngung der Probebäume ist jedoch genauso erforderlich wie die Verjüngung im Wald, nur so ist das Kollektiv der Probebäume repräsentativ für den Wald als Ganzes.